Теперь ученые могут исследовать вирусы, бактерии и компоненты человеческого организма более подробно, чем когда-либо прежде, благодаря программному обеспечению, разработанному в НИИ Скриппса.
В исследовании
Исследователи продемонстрировали, как программа под названием cellPACK может использоваться для моделирования вирусов, таких как ВИЧ.
«В конечном счете мы надеемся увеличить возможности ученых по таргетированию любой болезни», сообщил профессор Арт Олсон, старший автор исследования.
Программа cellPACK решает главную проблему структурной биологии. Хотя ученые уже разработали методы исследования относительно больших структур, таких как клетки, и относительно малых, таких как белки, структуры в среднем «мезомасштабном» диапазоне визуализировать сегодня сложней.
С помощью cellPACK ученые способны быстро и эффективно обрабатывать данные, собранные на меньших структурах, чтобы собирать модели в среднем диапазоне. Ранее исследователи собирали эти модели вручную, что занимало недели или месяцы по сравнению с несколькими часами с использованием программы cellPACK.
В качестве демонстрации мощности программы авторы нового исследования создали модель ВИЧ, которая позволяла увидеть, как внешние «шипиковые» белки распределяются по поверхности незрелого вируса.
Комментарии